En 2012, il obtient une bourse de Doctorat du Fonds pour la formation à la Recherche dans l’Industrie et dans l’Agriculture (FRIA) afin d’étudier la dynamique évolutive d’Adineta vaga, un rotifère bdelloïde. Cette thèse, menée au sein de l’équipe du Professeur Karine Van Doninck, combinait la génétique des population, la génomique comparative et la modélisation de communautés afin de comprendre comment une espèce asexuée qualifiée de « scandale de l’évolution » continuait de se diversifier en absence de reproduction sexuée.
Depuis la fin de sa thèse, Nicolas a rejoint E-BIOM où il mène la développement de nouvelles approches liées aux nouvelles technologies de séquençage pour la réalisation d’inventaires biologiques.